Перетаскивать мышью можно также папки с множеством pdf-файлов.
Mendeley не очень корректно обрабатывает русскоязычные статьи и данные о них часто приходится править вручную. Поэтому лучше вначале потренироваться на англоязычных статьях.
В качестве образца можете загрузить статью по ссылке и перетащить ее мышью из папки с загрузками в окно программы.
Существует не менее 10 способов добавить данные книг, статей и т.д. в вашу подборку в программе.
В том числе, бывает необходимо добавить данные источника вручную. Для этого в панели меню вверху программы нужно нажать на пункт меню File и выбрать Add Entry Manually (Добавить запись вручную). Откроется форма с пустыми полями. Внесите в поля формы соответствующие данные и после нажатия кнопки Save (Сохранить) в списке появится новый источник.